Sengketa batas wilayah antara Indonesia dan Malaysia bermula dari perbedaan tafsir mengenai batas wilayah yang terletak di perairan Ambalat, Laut Sulawesi. Indonesia dan Malaysia sama-sama mengklaim wilayah tersebut sebagai bagian dari zona ekonomi eksklusif (ZEE) masing-masing.
Masalah ini semakin rumit ketika perusahaan minyak asal Inggris, Cairn Energy, menemukan cadangan minyak di perairan Ambalat pada tahun 2005. Hal ini memicu ketegangan antara kedua negara dan berujung pada tindakan militer yang dilakukan oleh Malaysia.